До конца XIX века на территории Причудской волости никаких школ не было. По рассказам стариков, отдельные предприимчивые люди, умевшие читать церковно-славянские книги, устраивали в зимнее время у себя дома занятия с группой детей, родители которых хотели обучить их чтению церковных книг, по которым шло богослужение. За обучение, разумеется, взималась плата. Занятия сопровождались телесными наказаниями для нерадивых.
    В деревне Варнья жил, какой-то отставной солдат, который учил за определённую плату четырём арифметическим действиям. Преобладающее большинство русского населения (старообрядцы) было совершенно безграмотны. Ближайшая школа была в Алатскиви, но там обучение шло на эстонском языке. Посылать ребёнка учиться в Тарту было не по карману.
    Первая государственная школа в Колькьях появилась в 1901 году - так называемая "Емельяшина школа", приютившаяся в частном доме в Б. Колькьях. Это была начальная однокомплектная (возможная, четырёхклассная) школа, где работал один учитель. Вначале короткое время учительствовал Персидский (родом из дер. Вяльги), после него долгое время учительствовал Иван Спиридонович Козлов (родом из дер. Нина). Школу посещали далеко не все дети, а только желающие. (Некоторое время школа работала в двух частных домах (дом Цакухина).
    После того, как "Емельяшена школа "сгорела, под школу отвели кирпичный дом Белузова. Учителей было уже несколько человек.
    Первые сохранившиеся в школе достоверные писменые источники (протоколы педагогических советов), дающие представление о работе школы, относятся к 1929 году.
    В 1929-30 уч. году школа была четырёхклассная. Заведующий - А Оберпал, учителя: А.Суйтс, К. Недлер, Р. Баранин. Занимались в 2 смены.
    Как явствует из протокола №3 педсовета:
    "Согласно постановлению школьного попечительства решено праздновать годовщину школы 8-го января 1930 года."
    Школа называлась "Колецкое начальное училище ". В 1931 году школа преобразована в шестиклассную. В I, II, III классах учат Л. А. Фельс, А. А. Кусов, О. Кооль; в IV-VIклассах занятия проводятся по предметной системе; основные предметы ведут А. Д. Оберпал и Р. П. Баранин. В 1933 году в школу назначен новый заведующий. Оскар Грюлебаум.
    В 1935-36 гг. работало в школе 3 классных комплекта, всего 117 учащихся.
    В 1937-38 гг. заведующим школой назначен А. Дубковский, учителя Н. Ойнас и Г. Пиляцкая.
    В 1944-45 гг. школа получает новое название "Колькяская неполная средняя школа" (7 классов), директором школы назначен Р. П. Баранин.
    В 1947-48 учебном году в школе училось 223 ученика, работали в 2 смены.
    В 1949 году школа получила здание волисполкома, которое было отремонтировано и приспособлено для учебных занятий.
    В 1955 году после смерти Р. П. Баранина директором школы назначен Корхонен И.П.
    В июле 1956 года проводится капитальный ремонт здания. От прежнего здания остался лишь фундамент и наружные стены. Фактически школа получила новое здание.
    1959 год - школа электрифицируется. Керосиновые лампы сдаются на склад.
    1961 год - директором утверждён Н. И. Балуев.
    Весна 1965 ученики со своими учителями посадили рядом со школой берёзовую рощу, которая и сегодня украшает пасёлок.     1990 год проектируется новое здание школы и начинается его постройка. Но из-за развала СССР стройка останавливается.
    1995 год возобновляется строительство нового здания. Активное содействие в строительстве оказывает старейшина волости Н. И. Баранина.
    4 июля 1997 года новое школьное здание открыло двери. На торжественном открытии присутствовали президент Эстонской Республики Ленарт Мери, министр образования Маит Клаасен.
    1998 год в помещении школы открывается старообрядческий музей. Хранитель музея - Н.И. Баранина.

        Юри Плукк
        Директор школы